Portal kaldıgı yerden devam edyor. Chell karakterini canlandırıyoruz
amacımız acımasız süperbilgisayar GLADOS un verdigi problemleri çözmek ilk oyunun sonunda GLADOS u havaya uçurmuştuk bu oyunun başında Wheatley adında bir bilgisayarla ve onunla giderek yanlışlıkla GLADOSu uyandırıyoruz Wheatley ile GLADOS un yerdeyiştiriyoruz fakat bunun sonucu daha kötü oluyor.
Oyunun bu kısmından sonra aperture sciencenin yaratıcısı cave johnsonnın sesini duyuyoruz Hikaye olarak half lifenin evreinide geçtigi söylenilebilir zira halflife 2 ep 2 nin sonundaki borialis gemisindeki kargo aperture sciencea aitti ve altında gladosun imzası vardı.