İlk iki oyunda olduğu gibi yine bu oyunda da Gordon Freeman adlı bilim adamını yönetiyoruz ve Half-Life 2'den kaldığımız yerden tepesinde bir patlamaya neden olduğumuz citadelden başlayarak Şehir-17'den kaçmaya çalışıyoruz. Kaçmaya çalışırken Half-Life 2'den de tanıdığımız Alyx Vance bize oyun boyunca yardım ediyor.

Serinin diğer oyunlarına göre en kısa olanıdır ve yaklaşık 5-6 saatlik oynanış süresi vardır. kısa olmasına rağmen en az 20 saatlik oynanışa sığabilecek aksiyon ve duygu yüklü sahne vardır.